بالإضافة إلى المجاهر وأطباق بتري ، تعد أجهزة الكمبيوتر أداة مهمة لعلماء الأحياء الدقيقة. تتضمن برامج أبحاث علم الأحياء الدقيقة الأدوات المستخدمة من قبل التخصصات العلمية والهندسية الأخرى بالإضافة إلى التطبيقات المتخصصة لدراسة البكتيريا والكائنات الدقيقة الأخرى. تتوفر العديد من التطبيقات التي طورتها الوكالات الحكومية والمؤسسات غير الهادفة للربح أو الباحثون الأكاديميون كبرنامج مجاني للتنزيل والاستخدام حسب ما تتطلبه تجربتك أو معملك.
أدوات التصور
قد تساعدك الصورة المادية أو العقلية للبيانات الأولية التي تجمعها على فهم جودتها وأهميتها وتداعياتها بشكل أفضل. يتوفر برنامج عرض البيانات التجارية والمفتوح المصدر على نطاق واسع لأبحاث علم الأحياء الدقيقة. قم بإنشاء مخططات ورسوم بيانية لبياناتك باستخدام LibreOffice Calc أو Microsoft Excel أو نظام تصوير البيانات Mondrian. تساعدك تطبيقات Cell-O و RasMol على إنشاء نماذج متحركة ثنائية وثلاثية الأبعاد للجزيئات المهمة بيولوجيًا مثل البروتينات والأحماض الأمينية.
النمذجة الرياضية
غالبًا ما ينتج عن مجموعات كبيرة من بيانات علم الأحياء الدقيقة معلومات أكثر أهمية بمجرد تحليلها رقميًا. حزم برامج MATLAB و Octave و SciPy التي تقوم بإجراء تحسينات رياضية وتحليل ونمذجة بيانات العلماء. استخدم هذه الحزم للقيام بتقدير المعلمات من خلال تركيب المنحنى والتنبؤات الوبائية ومحاكاة النمو البكتيري وضوضاء البيانات أو القضاء على التأثير العشوائي. يقوم هذا التطبيق أيضًا بإجراء حسابات إحصائية ، مثل تحليل التباين أو اختبارات مربع كاي.
المعلوماتية الحيوية الجينوم
تساعدك تطبيقات برامج علم الأحياء الدقيقة أيضًا على تصور واستخراج المعلومات من تسلسل الأحماض النووية التي تشكل الحمض النووي للكائن الدقيق. توفر مؤسسة Open Bioinformatics Foundation تطبيقات مجانية ومفتوحة المصدر لتسلسل وتحليل الحمض النووي مثل BioJava و Biopython التي تستخرج البيانات من بنوك معلومات الجينوم ، وتحلل كود الحمض النووي للكائن الحي وتقارنه بعينات الحمض النووي الأخرى. تتضمن حزم تحليل الجينوم الإضافية Emboss و HMMER و Clustal Omega و Phylogeny Inference Package أو PHYLIP و Sequence Manipulation Suite أو SMS.
برامج مرجعية
تجعل الوتيرة السريعة للاكتشافات العلمية في علم الأحياء الدقيقة واللوائح الحكومية المتغيرة من الضروري أن يكون لعلماء الأحياء الدقيقة وصول سريع إلى المعلومات التي تؤثر على عملهم. HUGO عبارة عن حزمة برامج تجارية تزود علماء الأحياء الدقيقة بالمعلومات الحالية عن الأدوات والمواد الكيميائية والمعدات ووسائط الثقافة ومتطلبات السلامة والكائنات الجديدة والتغييرات التصنيفية والمضادات الحيوية. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن لعلماء الأحياء الدقيقة العاملين في علوم الأغذية استخدام تطبيق ComBase Browser Web للوصول إلى البيانات الميكروبيولوجية المتعلقة بالأغذية التي تقدمها الوكالات الحكومية في المملكة المتحدة وأستراليا والولايات المتحدة.
